Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Q1T7F1 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Q1T7F1 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Q1T7F1 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Q1T7F1 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Q1T7F1 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
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