Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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