Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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