Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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