Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GAPVD1Q14C86 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms