Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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