Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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ERV3-1Q14264 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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ERV3-1Q14264 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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ERV3-1Q14264 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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ERV3-1Q14264 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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ERV3-1Q14264 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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