Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM53BQ14153 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM53BQ14153 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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