Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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CDH18Q13634 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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