Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150 ms