Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms