Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms