Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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