Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms