Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms