Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms