Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms