Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms