Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms