Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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