Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGDP52209 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGDP52209 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGDP52209 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGDP52209 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGDP52209 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGDP52209 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGDP52209 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGDP52209 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGDP52209 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGDP52209 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms