Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms