Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms