Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms