Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD247P20963 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD247P20963 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms