Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LIG1P18858 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LIG1P18858 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LIG1P18858 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LIG1P18858 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LIG1P18858 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms