Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms