Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms