Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRMUO75648 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRMUO75648 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRMUO75648 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRMUO75648 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRMUO75648 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRMUO75648 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms