Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms