Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DENRO43583 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DENRO43583 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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