Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM247A6NEH6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM247A6NEH6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM247A6NEH6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms