Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms