Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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ARL2-SNX15V9GYD0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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ARL2-SNX15V9GYD0 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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ARL2-SNX15V9GYD0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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