Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP8AP2Q9UKL3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms