Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms