Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms