Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms