Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms