Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms