Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms