Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPRNQ16849 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPRNQ16849 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPRNQ16849 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPRNQ16849 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPRNQ16849 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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PTPRNQ16849 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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PTPRNQ16849 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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PTPRNQ16849 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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PTPRNQ16849 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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PTPRNQ16849 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRNQ16849 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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