Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAM2Q15035 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAM2Q15035 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAM2Q15035 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAM2Q15035 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAM2Q15035 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAM2Q15035 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAM2Q15035 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAM2Q15035 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAM2Q15035 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAM2Q15035 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAM2Q15035 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAM2Q15035 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAM2Q15035 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAM2Q15035 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRAM2Q15035 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAM2Q15035 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAM2Q15035 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAM2Q15035 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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TRAM2Q15035 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAM2Q15035 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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TRAM2Q15035 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAM2Q15035 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAM2Q15035 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAM2Q15035 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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TRAM2Q15035 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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TRAM2Q15035 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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TRAM2Q15035 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAM2Q15035 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAM2Q15035 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAM2Q15035 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAM2Q15035 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAM2Q15035 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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