Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
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