Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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