Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms