Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CD164Q04900 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CD164Q04900 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CD164Q04900 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CD164Q04900 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CD164Q04900 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CD164Q04900 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CD164Q04900 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CD164Q04900 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CD164Q04900 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CD164Q04900 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CD164Q04900 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CD164Q04900 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CD164Q04900 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CD164Q04900 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CD164Q04900 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CD164Q04900 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CD164Q04900 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CD164Q04900 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CD164Q04900 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CD164Q04900 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CD164Q04900 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms