Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms