Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms