Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms